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EBI-Roadshow-jp の変更点


[[English Page>EBI-Roadshow]]

** EBI 講習会 [#gf08f41f]

#dwrite(){{
<a target=_blank href="http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=EBIposter.pdf&refer=EBI-Roadshow"><img src="http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=EBIposter.jpg&refer=EBI-Roadshow" align="right" alt="EBI Roadshow poster"></a>
}}

この講習会は、[[Ensembl>http://www.ensembl.org/]]、[[ArrayExpress>http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/]]、[[InterPro>http://www.ebi.ac.uk/interpro/]]、[[BRENDA>http://www.brenda-enzymes.info/]]、[[PRIDE>http://www.ebi.ac.uk/pride/]]、[[IntAct>http://www.ebi.ac.uk/intact/]]、[[Reactome>http://www.reactome.org/]]などの、主にヨーロッパで開発されている公共データベースの使い方について知ってもらうことを目的としています。講習会では、これらのデータベースを開発・運用している欧州バイオインフォマティクス研究所 ([[EBI>http://www.ebi.ac.uk/]]) から講師をお招きして、各データベースに関する「講義」と、それらをPC上で実際に操作する「実習」を行います。詳細は [[EBI Roadshow>http://www.ebi.ac.uk/training/roadshow/]] のページをご覧ください。なお、講習会は英語で行われますのでご留意ください。

:日時| 2011年9月5日(月)- 6日(火)&br;
//計画停電の状況によっては日程が変更になる場合があります。
:場所| [[ライフサイエンス統合データベースセンター>http://dbcls.rois.ac.jp/access]](東京都文京区弥生2-11-16 東京大学工学部12号館4階)
:定員| 24人
:参加費用| 無料
:昼食| 軽食を用意します
:PC| こちらで用意します(Macbook)
:懇親会| 9月5日 17:30〜 (3,000円)

:申し込み|
お申し込みは英語でお願い致します。 &br;
8月8日に申し込みを締め切りますので、お早めのご登録をお願い致します。 &br;
#dwrite(){{
<a href="http://motdb.dbcls.jp/wp/?p=1" target="_blank">EBI講習会 申し込みフォーム</a><br />
}}
 申し込み受付は終了しました。
//#dwrite(){{
//<a href="http://motdb.dbcls.jp/wp/?p=1" target="_blank">EBI講習会 申し込みフォーム</a><br />
//}}
参加申し込みをされた方には、確認のメールを送信しております。メールが届かない方や、覚えのないメールを受けとられた方はお問い合わせのメールまでご連絡をお願い致します。

//---参加申し込みは締め切らせていただきました。たくさんのお申し込みありがとうございました。



:お問い合わせ|
EBI-roadshow at dbcls.rois.ac.jp


:主催| 
European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute ([[EMBL-EBI>http://www.ebi.ac.uk/]]) &br;
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 日本DNAデータバンク ([[DDBJ>http://www.ddbj.nig.ac.jp/]]) &br;
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター ([[DBCLS>http://dbcls.rois.ac.jp/]]) &br;
:共催| 科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター ([[NBDC>http://biosciencedbc.jp/]])


** プログラム [#wf5b910a]
:Day 1: Access to Genes and Genomes with Ensembl (Jana Vandrovcova)|
&color(white){0};9:00 - &color(white){0};9:15 Welcome remarks from the organizers &br;
&color(white){0};9:15 - &color(white){0};9:45 Introduction to [[EBI>http://www.ebi.ac.uk/]]: overview of most relevant databases (Lecture) &br;
&color(white){0};9:45 - 11:15 Origin, goals, data and analysis in the [[Ensembl>http://www.ensembl.org/]] project Website Walkthrough &br;
11:15 - 11:30 Coffee Break &br;
11:30 - 12:15 [[Ensembl>http://www.ensembl.org/]] exercises &br; 
&br;
12:15 - 13:15 Lunch &br;
&br;
13:15 - 14:15 Retrieving datasets using the data mining tool [[BioMart>http://www.biomart.org/]] (Lecture and exercises) &br;
14:15 - 15:15 Comparative genomics and proteomics: orthologues, protein families, whole genome alignments and syntenic regions (Lecture and exercises) &br;
15:15 - 15:30 Coffee break &br;
15:30 - 16:30 Variations: Single nucleotide polymorphisms in [[Ensembl>http://www.ensembl.org/]], comparison of strains, breeds, individuals using the browser and [[BioMart>http://www.biomart.org/]] (Lecture and exercises) &br;
16:30 - 17:15 Case Study Exercises, or browse your own gene or region

:Day 2: Transcriptomics and Pathways (James Watson)|
&color(white){0};9:00 - 10:30 Functional Genomics resources at the EBI: [[ArrayExpress>http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/]] and [[Expression Atlas>http://www.ebi.ac.uk/gxa/]] (Lecture) &br;
10:30 - 10:45 Coffee break &br;
10:45 - 12:30 [[ArrayExpress>http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/]]/[[Atlas>http://www.ebi.ac.uk/gxa/]] exercises &br;
&br;
12:30 - 13:30 Lunch &br;
&br;
13:30 - 15:30 [[Reactome>http://www.reactome.org/]]: a curated biological pathway database (Lecture and hands on) &br;
15:30 - 15:45 Coffee break &br;
15:45 - 17:00 More exercises & Questions &br;



** 日本で開催されるその他のEBI講習会 [#w6a089ab]
2011年9月7日&color(white){00/0}; 昭和薬科大学(東京) &br;
2011年9月8-9日&color(white){00}; 理化学研究所(横浜) &br;
2011年9月12-13日 大阪大学(大阪) &br;
//2011年9月15-16日 京都大学 iPS細胞研究所(京都) &br;
2011年9月15-16日 沖縄科学技術研究基盤整備機構(沖縄)

詳しくは http://www.ebi.ac.uk/training/roadshow/110905_Japan.html をご覧ください。

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