MotDB


AJACS66 の変更点


* 統合データベース講習会: AJACS河内 [#ubc5b0b1]
#dwrite(){{
<a target=_blank href="http://events.biosciencedbc.jp/training/ajacs66"><img width="211" src="https://events.biosciencedbc.jp/images/training/ajacs66_poster.png" align="right" alt="AJACS河内ポスター"></a>
}}

統合データベース講習会は、生命科学系のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する初心者向けの講習会です。

今回の講習会では、生命科学系データベースの[[カタログ>https://integbio.jp/dbcatalog/?lang=ja]]、[[横断検索>https://biosciencedbc.jp/dbsearch/]]、[[アーカイブ>https://dbarchive.biosciencedbc.jp/]]の使い方に加えて、パスウェイデータベース、遺伝子発現データベース、次世代シーケンサー解析、データ可視化についてご紹介します。参加者全員がハンズオンでコンピュータを使いながらの講習です。

:対象| 生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方(初心者向け)
:日時| 2017年8月24日(木)9:00-18:00
:会場| 関西医科大学第一講義室~
(大阪府枚方市新町2-5-1 枚方学舎1階)~
【[[アクセス>http://www.kmu.ac.jp/access/index.html]]/[[キャンパスマップ>http://www.kmu.ac.jp/access/hirakatashiaccess.html]]】
:定員| 約50名
:費用| 無料
:PC| 持ち込みPCを使用
//:申込| [[NBDCのサイト>http://events.biosciencedbc.jp/training/ajacs64]] からお申し込みください~
//申込締切:(申込締切:1月19日(木) 12:00まで) ※定員超過の場合は抽選となります
:申込|申し込み受付は終了しましたが、お席に若干の余裕がございますので、受講希望の方は、統合データベース講習会事務局までお問合せください。


** プログラム [#ebe44f0c]
 ***(紙配付資料有)の資料は、スライド4-6枚を1ページにまとめて印刷したものを配付いたします。***~
 *** &color(red){受講者アンケートにご協力をお願いいたします。};→[[こちら>https://form.jst.go.jp/enquetes/ajacs_questionnaire]]***

-8月24日(木)
--&color(white){0};9:00- 9:05 受入れ機関挨拶
--- 友田 幸一(関西医科大学長)
--&color(white){0};9:05-10:30 「NBDCの紹介とNBDCが提供するサービス」([[紙配付資料>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=AJACS66_20170824minowar3.pdf&refer=AJACS66]]有)(実習用サイト)→[[横断検索(講習会用1)>http://biosciencedbc.jp/dbsearch_new1/]]/[[横断検索(講習会用2)>http://biosciencedbc.jp/dbsearch_new2/]]
--- 箕輪 真理(科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンター/情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンター)
--10:30-10:40 休憩
--10:40-12:10 「パスウェイデータベースの紹介と疾患研究への応用」
--- 山西 芳裕(九州大学生体防御医学研究所)([[紙配付資料>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=170824Pathway_DB_yamanishi_submit.pdf&refer=AJACS66]]有)
--- 山西 芳裕(九州大学生体防御医学研究所)([[紙配付資料>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=170824Pathway_DB_yamanishi_submit_r.pdf&refer=AJACS66]]有)
--12:10-13:10 昼食休憩 
--13:10-14:40 「[[遺伝子発現DBを含む公共オミックスDBの使い方>https://github.com/AJACS-training/AJACS66/tree/master/03_bono]]」([[紙配付資料>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=AJACS66_bono.pdf&refer=AJACS66]]有)
--- 坊農 秀雅(情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンター)
--14:40-14:50 休憩 
--14:50-16:20 「[[次世代シーケンサー(NGS)データ活用の基礎>https://github.com/AJACS-training/AJACS66/tree/master/04_nakazato]]」([[紙配付資料>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=ajacs66.nakazato.out.pdf&refer=AJACS66]]有)
--- 仲里 猛留(情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンター)
--16:20-16:30 休憩 
--16:30-18:00 「Cytoscapeを使ったデータの可視化と解析」([[紙配付資料>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=AJACS66_Cytoscape20170824r.pdf&refer=AJACS66]]有)([[実習用データ>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=AJACS66_CytoscapeData.zip&refer=AJACS66]])([[WikiPathways>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=WikiPathways-3.2.1.jar&refer=AJACS66]])([[BiNGO>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=BiNGO.jar&refer=AJACS66]])([[stringApp>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=stringApp-1.1.0.jar&refer=AJACS66]])
--- 櫛田 達矢(科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンター)

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:お問い合わせ| 統合データベース講習会事務局 AJACS at biosciencedbc.jp までメールにてお問い合わせください
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:主催| 
科学技術振興機構 [[バイオサイエンスデータベースセンター>http://biosciencedbc.jp/]](NBDC)
:共催| 情報・システム研究機構 [[ライフサイエンス統合データベースセンター>http://dbcls.rois.ac.jp/]](DBCLS)~
[[関西医科大学>http://www.kmu.ac.jp/]]大学院講座

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&size(10){&color(gray){※AJACS(「あじゃっくす」と発音)とは・・・};};~
&size(10){&color(gray){ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材、アノテーター(Annotator)、キュレーター(Curator)、システムデータベース管理者(System DB administrator)の総称です(All Japan Annotator/Curator/System DB administrator)。AJACSな人は、統合データベースの作成、維持、管理にかかわる新たな職種です。};};~
&size(10){&color(gray){[[文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」>http://lifesciencedb.jp/]](平成18年度〜平成22年度)においては、主として[[ライフサイエンス統合データベースセンター>http://dbcls.rois.ac.jp/]](DBCLS: Database Center for Life Science)を担う人材として期待されてきました。平成23年度からは講習会等も新たな体制で実施されることになり、より幅広く活躍できるAJACSが生まれることを願っています。};};~