* 統合データベース講習会: AJACS岩手 [#a2efb636] #dwrite(){{ <a target=_blank href="http://events.biosciencedbc.jp/training/ajacs51"><img width="211" src="http://events.biosciencedbc.jp/images/poster_ajacs51.png" align="right" alt="AJACS岩手ポスター"></a> }} 統合データベース講習会は、生命科学系のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する講習会です。 今回の講習会は、最初に講習会受け入れ機関の岩手医科大学の清水先生から「[[東北MMB計画>http://www.megabank.tohoku.ac.jp/]]におけるバイオインフォマティクス」についてのお話を伺い、次いで、[[生命科学系データベースのカタログ>http://integbio.jp/dbcatalog/?lang=ja]]、[[横断検索>http://biosciencedbc.jp/dbsearch/]]、[[アーカイブ>http://dbarchive.biosciencedbc.jp/]]の使い方に加えて、[[KEGG PATHWAY>http://www.genome.jp/kegg/pathway.html]]を中心としたパスウェイDBの使い方、[[R>http://www.r-project.org/]]と[[Bioconductor>http://www.bioconductor.org/]]を使った基本的な解析方法、[[DDBJパイプライン>https://p.ddbj.nig.ac.jp/]]と[[Galaxy>https://p-galaxy.ddbj.nig.ac.jp/]]によるデータ解析方法などをご紹介します。参加者全員がハンズオンでコンピュータを使いながらの講習です。 :対象| 生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方 :日時| 2014年12月5日(金) 9:00〜17:45 :会場| 岩手医科大学矢巾キャンパスマルチメディア教室~ 【[[アクセス>http://www.iwate-med.ac.jp/access/]]/[[キャンパスマップ>http://www.iwate-med.ac.jp/education/school_life/yahaba-campus/]]】 :定員| 約30名 :費用| 無料 :PC| ご自身のPCをお持ち込みください。(無線LAN機器もお持ちであればご持参ください) //:USTREAM配信|講習会の様子は[[こちらから>http://www.ustream.tv/channel/ajacs]]配信の予定です。 //:申込| [[NBDCのサイト>http://events.biosciencedbc.jp/training/ajacs51]] からお申し込みください~ //申込締切:11月28日(金)まで ※定員超過の場合は抽選となります。 :申込|申し込み受付は終了しました。たくさんのお申し込みありがとうございました。 ** プログラム [#ue2549a9] --&color(white){0};9:00〜&color(white){0};9:20 「東北MMB計画におけるバイオインフォマティクス」 / 清水 厚志(岩手医科大学) --&color(white){0};9:20〜10:40 「NBDCの紹介とNBDCが提供するサービス」 / 箕輪 真理(科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター/情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター)[[講習資料>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=AJACS51_NBDC.pdf&refer=AJACS51]]/[[横断検索(講習会用)>http://biosciencedbc.jp/dbsearch_new/]] --&color(white){0};9:20〜10:40 「NBDCの紹介とNBDCが提供するサービス」 / 箕輪 真理(科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター/情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター)[[講習資料>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=AJACS51_NBDC141205.pdf&refer=AJACS51]]/[[横断検索(講習会用)>http://biosciencedbc.jp/dbsearch_new/]] --10:40〜10:50 休憩 --10:50〜12:20 「[[KEGG>http://www.genome.jp/kegg/kegg_ja.html]]/[[GenomeNet>http://www.genome.jp/ja/]]のWebサービスの紹介」 / 守屋 勇樹 (情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター) [[スライド>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=KEGG_2014_12_slide.pdf&refer=AJACS51]]/[[資料>http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=KEGG_2013_11.pdf&refer=AJACS51]] --12:20〜13:30 昼食 --13:30〜15:30 「[[RおよびBioconductorを使ったバイオデータ解析>./bono]]」/ 坊農 秀雅(情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター) --15:30〜15:45 休憩 --15:45〜17:45 「[[DDBJパイプラインとGalaxyによるデータ解析>https://gist.github.com/inutano/84862c5a3966697c576f]]」 / 大田 達郎(情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター) #br :お問い合わせ| 統合データベース講習会事務局 AJACS at biosciencedbc.jp までメールにてお問い合わせください #br :主催| 科学技術振興機構 [[バイオサイエンスデータベースセンター>http://biosciencedbc.jp/]](NBDC) :共催| 情報・システム研究機構 [[ライフサイエンス統合データベースセンター>http://dbcls.rois.ac.jp/]](DBCLS)~ [[岩手医科大学>http://www.iwate-med.ac.jp/]] [[いわて東北メディカル・メガバンク機構>http://iwate-megabank.org/]] 生体情報解析部門 ---- &size(10){&color(gray){※AJACS(「あじゃっくす」と発音)とは・・・};};~ &size(10){&color(gray){ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材、アノテーター(Annotator)、キュレーター(Curator)、システムデータベース管理者(System DB administrator)の総称です(All Japan Annotator/Curator/System DB administrator)。AJACSな人は、統合データベースの作成、維持、管理にかかわる新たな職種です。};};~ &size(10){&color(gray){[[文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」>http://lifesciencedb.jp/]](平成18年度〜平成22年度)においては、主として[[ライフサイエンス統合データベースセンター>http://dbcls.rois.ac.jp/]](DBCLS: Database Center for Life Science)を担う人材として期待されてきました。平成23年度からは講習会等も新たな体制で実施されることになり、より幅広く活躍できるAJACSが生まれることを願っています。};};~