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AJACS9/bono1

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目次


_ 統合データベースを使いこなすための最低限のコンピュータ使いこなし術

_ 参加者アンケート

  • おもにMacの人:6
  • おもにWindowsの人:18
  • ウェブブラウザはInternet Explorerの人:8
  • ウェブブラウザはFireFox?の人:8
  • ウェブブラウザはSafariの人:4
  • ウェブブラウザはOperaの人:0
  • データベースを良く利用する人:10
  • バイオインフォマティクスを使っている人:7
  • プログラミングをたしなむ人:1
  • データベースを構築している人:2
  • データベースを構築したい人:3
  • ライフサイエンス統合データベースセンターの存在を知っていた人:8

_ インターネット検索

ま、とにかく、まずは「ググれ」

http://www.google.co.jp/

_ Google

詳しくはAJACS湘南/講習内容/part1を。

DBCLS

でググると、

  • 「日本語のページを検索」 約 100,000 件
  • 「ウェブ全体から検索」 約 110,000 件
  • 【演習1】検索窓右の「検索オプション」をクリックして絞り込みをかけてみなさい。.co.jpのドメインでは何件ぐらいに絞り込まれますか?またさらに見る数を減るにはどういうオプションを指定すればいいだろうか?
  • 【演習2】DBCLSは「ライフサイエンス統合データベースセンター」の略号であるが、たまに「ライフサイエンス総合データベースセンター」と間違えられる。そう間違えられている例を"で囲うことでインターネット検索エンジンを用いて抽出しなさい。

_ NCBI Entrez

「NCBIのデータベース」の入り口。

http://www.ncbi.nih.gov/

  • 【演習3】NCBI Entrezで'DBCLS'を検索しなさい。検索結果のページでFirefox右上の検索窓左のアイコンをドラッグしてみなさい。普通の状態と何がかわったか?

_ 略語検索エンジンAllie

  • 【演習4】'DBCLS'で検索しても「ライフサイエンス統合データベースセンター」以外の'DBCLS'はインターネット上にそれほどないためそれほど困らないが、'SPF'を検索して見なさい。どういったことが起こるか?

バイオな略語の正式名称を調べたい場合は、

http://allie.dbcls.jp/

を使いましょう。

  • 【演習5】Allieを用いて'iPS'を検索してみなさい。

_ 「データベース」の検索

統合ホームページ中の項目でアイコン(これ→http://lifesciencedb.jp/image/small_video_icon.gif)があるサービスは統合TVの動画による説明があります。実際に使う前に是非ご覧ください。

_ データベースカタログ

文字通り「データベースのデータベース」。日本国内のものが中心。DBの形式、対象、生物種、提供機関などで分類されている。
統合TV: http://togotv.dbcls.jp/20080508.html を参照(YouTube版: http://jp.youtube.com/watch?v=vAcuL1c3nto )

  • 【実習1】データベースカタログにアクセスし、「DB型」→「プロジェクト」のカテゴリーを表示しなさい。
  • 【実習2】「表示形式」を「サムネイル」から「リスト」に変更してみなさい。その変更によってどういう情報が新たに付加されたか?
  • 【実習3】「ソート」をいろいろと変更してみなさい。
  • 【応用1】サムネイルに「休止中」と書かれたデータベースを見つけなさい。それらはなぜ休止中となっているか、その理由を考えてみなさい。
 
Last-modified: 2009-04-17 (金) 13:25:08 (3999d)