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AJACS5/oreno

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目次


_ 講習用パソコンのログインアカウントについて

  • アカウントを持っていない方は申し出てください。
  • アカウントを持っている方は、ご自分のアカウントを使ってログインしてください

_ 自己紹介

  • 河野 信(かわの しん)といいます
  • 旭川出身
  • 北大工(酢酸菌のセルロース合成) → 京大化研(糖鎖の構造予測) → 行方不明 → ライフサイエンス統合データベースセンター

_ 参加者アンケート

  • おもにMacの人:1
  • おもにWindowsの人:
  • ウェブブラウザはInternet Explorerの人:13
  • ウェブブラウザはFireFox?の人:3
  • ウェブブラウザはSafariの人:1
  • ライフサイエンス統合データベースセンターの存在を知っていた人:2

_ 統合データベースを使いこなすための最低限のコンピュータ使いこなし術

_ PC操作の基本

クリック
マウスのボタンを押すこと。左側のボタンを押せば「左クリック」、右側のボタンを押せば「右クリック」
ダブルクリック
マウスのボタンを2回連続で押すこと
ドラッグ
マウスのボタンを押したままマウスを動かすこと
部分選択
選択したい部分で、マウスの左ボタンを押しながらドラッグする
全選択
キーボードの「Ctrl」ボタンを押しながら「A」を押す(Macの場合は「Ctrl」の代わりに「command」ボタンを押しながら「A」)
コピー
キーボードの「Ctrl」ボタンを押しながら「C」を押す
ペースト
キーボードの「Ctrl」ボタンを押しながら「V」を押す

_ まずはこのページにたどり着く

  • ウェブブラウザ(Internet Explorer?)を開いて
  • ページの下の方に講習会のプログラムがあります。タイトルをクリックすると、各講習の資料のページに行けます。
  • このページを開いたまま、他のページを開くには
    • リンクをクリックするときに「右クリック」でクリックするとメニューが出てきます
    • 「新しいウインドウで開く」もしくは「新しいタブで開く」を選ぶと、元のページを残したまま新しいページを開けます。

_ インターネット検索

ま、とにかく、まずは「ググれ」

http://www.google.co.jp/

_ Google

詳しくはAJACS湘南/講習内容/part1を。

Database Center for Life Science

でググると、

  • 「日本語のページを検索」 50,900件
  • 「ウェブ全体から検索」 2,880,000件
  • 【演習】上記語句で検索してみましょう
  • 【演習】検索窓の右にある「検索オプション」をクリックして絞り込みをかけてみましょう。「フレーズを含む」に上記語句を入力して検索すると、結果はどうなりますか?
  • 【演習】「キーワードを含めない」に dbcls と入力して検索すると、結果はどうなりますか?
  • 【演習】Yahoo!JAPANの検索エンジンでは何件?




blast

について調べてみる。

  • 【演習】googleに戻って、上記語句で検索してみましょう
  • 【演習】「検索オプション」の「filetype」に ppt を指定して検索すると、結果はどうなりますか?

_ 統合TV

  • 【演習】「番組を検索する」に blast と入力して検索してみましょう
  • 【演習】統合TVのトップページに戻って、「番組カテゴリから探す」の「発現情報をクリックしてみましょう」

_ NCBI Entrez

「NCBIのデータベース」の入り口。

http://www.ncbi.nih.gov/

  • 【演習】NCBI Entrezで'E. coli'を検索してみましょう。
    • 【小技】FireFox?の場合、検索バー(ブラウザの右上にある「G」マークのところ)をクリックすると、「Entrez search」を検索バーに登録できます

_ PubMed

泣く子も黙るNational Center for Biotechnology Information (NCBI)提供の学術論文検索の総本山

Site: http://pubmed.gov (pubmed.org でも可)

  • 【演習】E. coli O157のゲノム決定論文を探してみよう
    1. 検索窓に E. coli と入れてGoをクリック
      • 「Items of」の部分に表示されている 数字が検索の結果ヒットした数
    2. O157 を追加して「E. coli O157」で絞り込み検索する
    3. さらにgenome を追加して「E. coli O157 genome」で検索する
      次第に絞り込まれ数が減少していく
    4. completeを追加して完全ゲノムの論文を絞り込む。
      これくらいの件数になれば、タイトル・アブストラクトを見ればよい。
    5. 【小技】実際にどのようなタームに展開されて検索されているかは「Datails」タブをクリックするとわかる
      「MeSH (Medial Subject Headings)」とはデータベース側で定義されたキーワード(メタデータ=タグ)
      「Query Translation」を編集すれば、自分の思い通りの検索ができるが、素人にはお勧めできない。
    6. 【小技】より一層の絞り込みは「Preview/Index」タブをクリックして指定するとよい。たとえば「Title/Abstract」や「Author」「Publication Date」を指定するなどで絞りこめる
  • 【小技】FireFox?の場合、検索バー(ブラウザの右上にある「G」マークのところ)をクリックすると、「Pubmed search」を検索バーに登録できます

_ 研究を円滑に?進めるための情報共有ツール

_ ローカルで(or 共同研究者と)のファイルのやり取り

  • Wiki
    • ブラウザから書き込める掲示板。アクセスコントロールすることで、特定の人だけが使えるようにできる。
  • IP Messenger [#zcf7a76a]
    • LAN用メッセージングソフト。要するに研究室内の他の人にファイルを送るためのソフト。
    • http://www.ipmsg.org/
  • Skype, AIM/iChat [#hf107430]
    • アカウントを取る必要がありますが、LAN以外の共同研究者とメッセージやファイルををやりとりしたりできます。
skype
http://www.skype.com/intl/ja/
AIM
http://www.jp.aol.com/aim/index.html
  • RSSリーダー
    • RSSに対応しているページを登録しておくと、ウェブを定期的に巡回して最新の情報を集めてくれる
    • FireFox?やSafariだとブラウザに登録できる
    • ウェブ上に登録することもできる
  • Twitter
    • 日常の些細なことをつぶやく。質問をぼそっとつぶやくと、誰かが答えてくれることも?
    • http://twitter.com
 
Last-modified: 2008-10-18 (土) 13:33:56 (4191d)