_ 統合データベース講習会: AJACSみちのく2

統合データベース講習会は、生命科学系のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する講習会です。

今回の講習会では、1日目は生命科学系データベースのカタログ、横断検索、アーカイブの使い方や生命科学系の主要なデータベース（DDBJ：DNA Data Bank of Japan、PDBj：Protein Data Bank Japan、KEGG： Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）の使い方について、また、Cytoscapeの使い方を紹介します。2日目はRおよびBioconductorを使った次世代シークエンサデータの解析のほか、遺伝子発現データベースや解析ツールをご紹介します。参加者全員がハンズオンでコンピュータを使いながらの講習です。

対象

生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方

日時

2012年8月23日（木） 13:00〜18:00、8月24日（金） 9:00〜16:30

会場

東北大学星陵地区IT教育施設 （医学部4号館6階） 【アクセス】

定員

50名

費用

無料

PC

会場備え付けのwindows PCが利用可能です。PCの持込みも可能です。
※PCを持ち込む場合、無線LANに接続できるPC環境とEAST IDが必要です。

申込

NBDCのサイト からお申し込みください
申込締切：8月20日(月)12:00まで　※定員超過の場合は抽選となります。

_ プログラム

• 8月23日（木）
  • 13:00〜14:30　「NBDCの紹介とNBDCが提供するサービス」 資料（PDF, 7.8MB） 　大波純一　（科学技術振興機構　バイオサイエンスデータベースセンター）
  • 14:30〜14:45　休憩
  • 14:45〜16:15　「主要なDB（DDBJ、PDBj、KEGG）の使い方」 資料（PDF, 15MB） 　河野信　（情報・システム研究機構　ライフサイエンス総合データベースセンター）
  • 16:15〜16:30　休憩
  • 16:30〜18:00　「Cytoscapeを使ったデータの可視化」 資料（PDF, 5MB）、データ 　櫛田達矢　（科学技術振興機構　バイオサイエンスデータベースセンター）

• 8月24日（金）
  • 09:00〜12:00　「R＋Bioconductorを使ったNGS解析」　二階堂愛　（理化学研究所　発生・再生科学総合研究センター）
  • 12:00〜13:30　昼食
  • 13:30〜16:30　「遺伝子発現DB・解析ツールの紹介」（内容）　仲里猛留　（情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター）

お問い合わせ

統合データベース講習会事務局 AJACS at biosciencedbc.jp までメールにてお問い合わせください

主催

独立行政法人　科学技術振興機構　バイオサイエンスデータベースセンター　（NBDC）

共催

東北大学大学院医学系研究科
大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構(ROIS) ライフサイエンス統合データベースセンター　（DBCLS）

※AJACS（「あじゃっくす」と発音）とは･･･
ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材、アノテーター(Annotator)、キュレーター(Curator)、システムデータベース管理者(System DB administrator)の総称です(All Japan Annotator/Curator/System DB administrator）。AJACSな人は、統合データベースの作成、維持、管理にかかわる新たな職種です。
文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」（平成18年度〜平成22年度）においては、主としてライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS: Database Center for Life Science)を担う人材として期待されてきました。平成23年度からは講習会等も新たな体制で実施されることになり、より幅広く活躍できるAJACSが生まれることを願っています。