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AJACS33/yayamamo

AJACS33


目次


_ 文献の検索とその整理方法

山本泰智

スライド

_ PubMed?検索最新情報とMeSH

PubMed?の検索インターフェースは比較的頻繁に更新されます。普段利用している方も新しい機能やインターフェースについて確認しておくと良いと思います。

NCBIによる動画チュートリアル

また、MeSHを利用することで、より効率的に目的の文献を見つけることが出来ます。これまで意識して利用したことの無い方は、この機会に試してみると良いと思います。

_ 試してみる。

下記の語をMeSHデータベースで検索してみましょう。

  • orange
  • lemon
  • grapefruit
  • tangerine

また、それらのMeSHタームが主題として付けられている文献を検索してみましょう。

適宜geneticsなどの副題を追加して検索結果の違いを確認しましょう。

_ Allie (アリー) を使って略語の使い方を検索

生命科学分野の文献では略語が多用されます。Allieはその展開形を文献情報や共起略語(同じ文献情報に出現する他の略語)などと共に検索します。

同じ略語で異なる展開形が存在する事例(多義性を持つ略語)や、一つの展開形に対して複数の略語が存在する事例(各略語は互いに類義語の関係にある)があるため、文献中に展開形なしに略語のみで出現していると、読者を混乱させることになります。

Allieでは略語を入力すると、その展開形の一覧を、それが出現する文献情報や共起略語とともに表示するので、略語の意味を知るための一助となります。

_ 試してみる。

  • CAT を検索
  • 共起略語をみて、Citrus関連文献でより多く使われているものは何か確認する
  • 目的の展開形について、詳細情報として実際に利用されている表現や文献リストを確認する

その他、ROS や HPLC、SODについて、それぞれ展開形の候補リストや、各候補について、その意味で主に使われている研究分野や同じ文献で出現する共起略語を確認する。

また、Allieのサイトから、Allieで検索可能なすべての略語と展開形、およびそれらが出現するPubMed? IDのデータベースをフリーでダウンロード出来るようになっています。

_ inMeXes? (インメクセズ) を使って文献中の英語表現を検索

英語非ネイティブ研究者が英作文中によく出くわすだろう問題として、前置詞の使い分けや馴染みの無い単語の綴りなどがあると思います。

inMeXes?を利用することで、より簡単に、実際の生命科学系論文で使われている用例を検索出来ます。

_ 試してみる。

下記の表現に続く前置詞を確認しましょう。

  • contribute
  • information
  • in conjunction
  • in regard

検索結果を他の利用者とURL(パーマリンク)を介して共有出来ます。

_ TogoDoc? Suite (統合ドックスイート) を使って文献情報を管理

電子ジャーナルの発達で多くの論文がPDF形式で全文を読めるようになりましたが、読後のファイルの管理はおろそかになりがちです。 その一方で、自信の研究あるいは興味のある分野に関連の深い論文の発表件数は年々増加をし続け、効率的に見つけることが困難になって来ていると考えられます。 そこで、既にPCのディスクに保存されている論文情報を抽出し、それに基づいた文献の検索が出来れば、それは利用者にとって興味のある文献を効率的に得る協力な手段となり得るでしょう。

TogoDocClient?は各利用者のPCにインストールして利用するソフトウェアで、TogoDoc?はDBCLSのサーバーにあるウェブサービスです。 両者は互いに連携し、上記の問題に取り組むシステムを実現しています。TogoDocClient?は指定されたフォルダにあるPDF形式のファイルを全て解析し、タイトルや著者名などの書誌情報を抽出します。 得られた結果はTogoDoc?に送信され、続いて、それに基づき、最新のMEDLINE所蔵文献情報から関連性の高い順に提示します。 更に、今年新たに登場したTogoDocMobile?を利用することで、iPhoneやiPad、iPod TouchといったiOS端末で推薦文献をチェックしたり登録したりすることが出来ます。

なお、TogoDocClient?を利用することでPCに保存されているPDF形式ファイル名を予め指定した形式に一括変換出来ます。

推薦機能を利用するにはオープンIDが必要になります。 DBCLSの提供するオープンIDを利用すると、サインインの処理を簡略化出来ます。 アカウントの作成はこちらから可能です。

_ 試してみる。

アカウントを既にお持ちの方は、PubMed?検索をして新規に文献を追加してみましょう。

また、iPhoneなどの端末をお持ちの方はTogoDocMobile?アプリをインストールして推薦文献を確認してみましょう。

 
Link: AJACS33(1903d)
Last-modified: 2012-08-06 (月) 19:00:46 (1903d)