MotDB


AJACS33/bando

AJACS33

実習内容メモ

<Integbioデータベースカタログ>
http://togodb.dbcls.jp/integbio_dbcatalog

● 「植物」に関係するDBは何件登録されているでしょうか。
● 「生物種」や「運用機関所在国」の項目を追加しましょう。
●  特定の生物種 (oryza sativa等)のDBを探してみましょう。
●  検索結果を利用してHPに”植物関連DBリンク集”を掲載する際に利用条件はあるでしょうか?

<生命科学横断検索>
http://biosciencedbc.jp/dbsearch/

実習1「キュウリ モザイクウイルス」で検索する。
●キーワードの日英変換を確認しましょう。
●カテゴリを用いて検索結果を絞り込んでみましょう。
●蛋白質の構造情報を調べてみましょう。
●図鑑で類縁のウイルスや画像を調べてみましょう。

実習2「クリプトクロム (CRY)」で検索する。
●国内で最近報告されている知見を調べてみましょう。
●ヒトの遺伝子に検索結果を絞り込んでみましょう。

●オリジナルサイトやGoogleの検索との違いを考えましょう。

<生命科学系データベースアーカイブ>
dbarchive.biosciencedbc.jp

●Knapsack Familyを一覧から探してどのようなデータベースかメタデータを眺めましょう。
●Lunch Box&Tea Pot (食用植物データ)を選び、どのようなデータかメタデータを眺めましょう。
●Lunch Box&Tea Potから興味のある植物のエントリーを検索してみましょう。例:Malus pumila
●学名のリンク (Core System 生物種-代謝物関係データへ)からその種の代謝物の知見がまとめられているか調べてみましょう。
● 検索結果をダウンロードしてみましょう。
● ダウンロードしたデータを利用する際の条件を確認しましょう。

 
Link: AJACS33(1835d)
Last-modified: 2012-08-06 (月) 12:52:07 (1836d)